Покрай многото нови модели и концепции показани от Hyundai, преминалият през фейслифт Matrix не предизвика особени реакции. Това не е много естествено, защото става дума за един от успешните модели на фирмата в компактния MPV сегмент.
Промените в автомобила са доста значителни както във външния вид, така и в интериора. Matrix модел 2009 има изцяло нова предница с различна предна броня, нова форма на отворите за въздух и фарове за мъгла, нова радиаторна решетка и по-големи фарове с интересна форма. Нов дизайн има и капака на мотора. 
В сравнение с изцяло променената предница, задната част е изменена по-малко. Нова е задната броня, с различни светлини за мъгла. При обновения Hyundai Matrix се предлагат пет нови цвята за каросерията. 
И след фейслифта автомобилът се предлага с три двигателя. Два са бензинови с обем 1.6 и 1.8 литра и мощност, съответно 103 и 123 к.с. Третият е турбодизел 1.5 CRDi с мощност 110 к.с. И трите двигателя се комбинират с пет степенна механична скоростна кутия, а при двата бензинови агрегата може да се избере и 4 степенен автомат. 