Останалата част от промените не се забелязва на пръв поглед. При двигателите прави впечатление новият V6 TDI, който сега прави своята премиера именно при обновения Phaeton. Това е агрегат, който изпълнява изискванията за вредни емисии Euro 5. Работният му обем е 3.0 литра и има мощност от 233 к.с.(171 kW), а максималният въртящ момент е 450 Nm.
С този двигател Phaeton ускорява от място до 100 км/час за 8.4 секунди и има максимална скорост 236 км/час. Според производителите комбинираният разход на гориво е 9.6 литра на 100 км.
Версията Phaeton V6 TDI ще бъде продавана само като 4х4 и ще има шестстепенна скоростна кутия. Цената в Европа започва от около 70 000 евро.
Освен този нов двигател обновения Phaeton получава и редица нови „интелигентни” системи. Една от тях е адаптиращият се към пътната обстановка темпомат (Adaptive Cruise Control - ACC) който има и нова функция “Follow to Stop“. Благодарение на нея автомобилът може напълно да спре при задръстванията, а след това отново да се включи със скоростта на колоната в движението.
Освен това новият Phaeton предлага и системите “Front Assist“ и “Side Assist“. Първата при нужда регулира отстоянието от колата намираща се пред автомобила, а втората подпомага водача при смяна на пътната лента на движение.
Новият Phaeton се предлага и с по-съвременна DVD система, както и с навигационна система ново поколение с повече функции. Предлага се и командван с глас телефон с Вluetooth връзка.
Както и при досегашната версия могат да се поръчат и двигателите V8 и W12. Може да се поръча и удължена версия на автомобила със 120 мм, която предлага повече място на задната седалка.